La
Taxonomía (del
griego τάξις
táxis ‘ordenamiento’ y νόμος
nómos ‘norma’ o ‘regla’) es, en su sentido más general, la ciencia de la
clasificación. Habitualmente se emplea el término para designar a la
Taxonomía Biológica, la «teoría y práctica de clasificar organismos».
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cita 4 Como se la entiende en la actualidad, la clasificación biológica tiene que ser
congruente con las hipótesis de
árbol filogenético disponibles, en ella, los organismos se agrupan en taxones mutuamente excluyentes a su vez agrupados en taxones de rango más alto también mutuamente excluyentes, de forma que cada organismo pertenece a uno y sólo un taxón en cada rango o "categoría taxonómica". En cada taxón, los organismos poseen caracteres (singular
carácter) cuyos estados del carácter los diferencian de los organismos fuera del taxón, y son los
atributos que en conjunto se utilizan para delimitar los taxones biológicos. La mayoría
cita 5 de los especialistas ve a las especies, a las que ubican en taxones en la categoría taxonómica del mismo nombre, como una realidad objetiva, y a los diferentes conceptos de especie como diferentes aproximaciones para reconocer los linajes que evolucionan independientemente, por lo que a pesar de las discrepancias entre autores en su
concepto taxonómico y por lo tanto en general en los
límites taxonómicos de cada una, suele ser considerada la categoría taxonómica más importante
cita 6
cita 7 en la clasificación. Los taxones supraespecíficos son los que agrupan especies y se jerarquizan en categorías taxonómicas de rango cada vez más alto: género (grupo de especies), familia, etc. hasta el reino. En esta área también está debatido el
concepto de taxón a utilizar. Muchos especialistas afirman que sólo la "filosofía taxonómica" para agrupar los organismos en taxones de la
escuela cladista logra que la clasificación ofrezca el servicio que se espera de ella al resto de las ramas de la biología, pero la
escuela evolucionista tiene razones para delimitar con otros conceptos los taxones, también congruentes con las hipótesis de árbol filogenético, y las dos escuelas se atribuyen la creación de sistemas de clasificación que cumplen en mayor medida sus funciones de
sistemas de almacenamiento y recuperación de datos, y de
predictoresdel estado de los caracteres y las direcciones de la evolución que no se han medido.
La Taxonomía también se ocupa de debatir y actualizar los
Códigos Internacionales de Nomenclatura, de los que por razones históricas hay uno para cada disciplina (Zoología, Botánica y Bacteriología), cuya utilización para reglamentar el uso de nombres "formales" está consensuada desde hace unos 100 años. Un Código define el sistema taxonómico —los Códigos en uso definen el recién descripto, conocido como el "sistema lineano", del que se deriva la definición de taxón más abajo descripta—; decide cómo se forman los nombres y cuál es el "tipo" con el que se heredan de taxón en taxón, y explicita sus
Principios de Nomenclatura, cuya validez está por encima de las reglas, con el objetivo o "principio básico"
19 de proveer la máxima estabilidad en la nomenclatura. Los Códigos en uso no evitan las "diferencias filosóficas" entre taxónomos en los
conceptos taxonómicos a utilizar ni en la categoría especie ni en las categorías supraespecíficas que son una fuente de inestabilidad frecuente en los nombres de los taxones.
La Taxonomía Biológica es aquí tratada como una subdisciplina de la
Biología Sistemática, que además tiene como objetivo la reconstrucción de la
filogenia, o historia evolutiva, de la vida.
cita 3 Como aquí comprendida la Taxonomía abarca la decisión de qué sistema taxonómico utilizar, la de qué
conceptos taxonómicos asociar a esos taxones, la delimitación de esos taxones dejando explícitos los métodos que fueron utilizados para alcanzarla, la formalización de sus nombres en la subdisciplina de la Nomenclatura, y también las herramientas para la
Determinación o identificación de especímenes.
cita 3
cita 6 Como se calcula que sólo un 10% de las
especies está descripto, esas descripciones tienen diferentes grados de resolución,
cita 8 y las especies evolucionan (cambian con el tiempo en términos de sus caracteres) y cambia su distribución, la determinación funciona recursivamente con la descripción y catalogación de especies en el área llamada
alfa-Taxonomía o
Taxonomía Descriptiva, o, deslindándola de la definición minimalista de Taxonomía que se maneja desde hace décadas y debido a que se intergradan (se van indiferenciando a medida que el foco de atención se traslada de una a la otra) en esa categoría taxonómica, el área de la
Sistemática Descriptiva23 o
Ciencia de la Biodiversidad,
cita 6 la que se ocupa del descubrimiento, la identificación, la descripción, la clasificación y la catalogación
cita 6 de la biodiversidad del planeta, utilizando el organismo como unidad de trabajo y cuya prioridad
24 es la descripción de todas las especies dentro de un contexto evolutivo.
cita 6
La Historia de la Taxonomía ha sido largamente recorrida por éstos y otros interrogantes y a lo largo de ella fueron formándose el sistema de clasificación y las reglas que nos han quedado como legado.
La crisis de
biodiversidad que es foco de atención desde mediados de 1990, la cantidad de datos acumulados con los
análisis de ADN, y la posibilidad de intercambiar información a través de internet, han revitalizado a esta ciencia en el ambiente científico desde las décadas de 1990-2000, y han generado un debate acerca de la necesidad de hacer reformas sustanciales a los Códigos, algunas de las cuales aún se están debatiendo y otras ya se han incorporado. Algunas de estas propuestas son el BioCode, el PhyloCode, el agregado de atributos al tipo nomenclatural como podrían ser los nuevos "marcadores de ADN" (ADN
barcodes), y las relacionadas con la informatización de los datos y la utilización formal de Internet.
